福岡大学教職員組合は組合員の諸権利の擁護と拡大、労働条件の改善、そして組合員の社会的･文化的生活の保障・向上を図るとともに、教育、研究、医療の民主的発展の及び大学運営の民主化を進めることを目的（規約第3条）としています。

• 大会 組合最高議決機関です。組合員5名に1名の割合で選出された代議員をもって構成されます。原則として12月に開く定期大会と、必要に応じて召集される臨時大会があります。
• 執行委員会 大会の決議事項と緊急事項を執行する組合の執行機関です。
• 選挙管理委員会 組合の選挙を実施、管理する委員会です。
• 各委員会･対策委員会 中央及び両支部の活動を行うために、各委員会･対策委員会が執行委員会で設置されています。どのような委員会を設置するかは、その年の活動計画に基づき決定されます。
• 職場懇談会 組合の最も基本的な活動の一つ。

• 執行委員長 組合を代表し、執行機関として組合業務を統括します。
• 執行副委員長 委員長を補佐し、委員長に事故あるときはその業務を代行します。
• 書記長 委員長を補佐し、組合の業務一般を処理します。
• 執行委員 業務を分担、処理します。（支部執行委員は選出されたブロックの意見を集約し、執行委員会に報告します。）
• 代議員 組合の最高議決機関である大会に出席し、意見を述べ議決を行います。
• 対策委員･専門委員 各対策委員会に出席し、問題の洗い出し、出された問題の調査、分析を行い基礎データを作成します。
• 会計監査委員 組合の会計事務、資産を監査します。
• 選挙管理委員 組合の各種選挙を実施、管理します。